Институт является ведущим научным учреждением Казахстана, решающим проблемы перерабатывающего и пищевого производств агропромышленного комплекса.

В состав КазНИИППП входят Головной институт, расположенный в г. Алматы, Астанинский и Семейский филиалы ​

Головной институт и его филиалы в своем составе имеют научные и проектные лаборатории, экспериментальные производства.

НАПРАВЛЕНИЯ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ:

• Оценка эффективности использования новых технологий и оборудования в перерабатывающей и пищевой промышленности, выполнение работ по совершенствованию и разработке нового оборудования и технологий производства продуктов питания из животного и растительного сырья, в том числе для хлебопекарной, кондитерской, плодоовощной, мясо-молочной, бродильной, пивобезалкогольной, винодельческой, комбикормовой и других отраслей
• Формирование оптимальных технологических режимов и конструкций оборудования для  глубокой и комплексной переработки растительного и животного сырья с целью получения новых продуктов питания функционального назначения, в том числе национальных продуктов, а также пищевых и биологически активных добавок для обеспечения качества и безопасности сырья и продуктов питания
• Формирование, сохранение и развитие генофонда микроорганизмов для пищевой промышленности
• Обоснование совместно с институтами НАО «Национальный аграрный научно-образовательный центр» (НАО «НАНОЦ») исходных требований и разработка технологий глубокой переработки растительного и животного сырья и производства новых продуктов питания и комбикормов
• Нормативно-методическое обеспечение агропромышленного комплекса
• Трансферт и адаптация современных способов и технологий производства пищевых продуктов​ 

Институт имеет огромный опыт в проведении научных исследований  и   высокий квалификационный уровень сотрудников,  в институте работает 126 сотрудников: научных сотрудников – 79; докторов наук – 9, в т.ч.               1 академик НАН РК; кандидатов наук – 8; PhD- 6;  магистрантов – 38.

Инфраструктура. Для выполнения научно-исследовательских работ Головной институт имеет 5 научно-исследовательских лабораторий, имеющих соответствующую материально-техническую базу:

• Лаборатория технологии переработки и хранения продуктов растениеводства
• Лаборатория технологии переработки и хранения продуктов животноводства
• Лаборатория технологии хлебопекарного производства
• Лаборатория биотехнологии, качества и пищевой безопасности
• Лаборатория технологии  зернопродуктов и комбикормов​

Имеется: хлебопекарный цех, исследовательские и экспериментально-лабораторные линии – линия по производству колбас, линия по переработке молока, линия по производству комбикормов и кормовых добавок.     

Постановлением Правительства РК № 830 от 30 июля 2002 года «О республиканской коллекции микроорганизмов» на базе института действует официальный Депозитарий коллекции микроорганизмов для пищевой и перерабатывающей промышленности (АПК). В коллекции на хранении и изучении находится более 2000 единиц хранения культур микроорганизмов. Являясь официальным депозитарием в коллекцию принимаются культуры микроорганизмов от научных и производственных организаций. Коллекционные культуры используются для создания новых препаратов и заквасок в научных исследованиях института (препараты для животноводства, птицеводства и рыбоводства, закваски для пшеничного и ржаного хлеба и др.).